Όπως και με οποιαδήποτε χειρουργική επέμβαση, μπορεί να υπάρξουν βραχυπρόθεσμες και μακροπρόθεσμες επιπλοκές, όπως αιμορραγία, διαφυγή, θρόμβωση στα κάτω άκρα (εν τω βάθει φλεβική θρόμβωση, DVT) ή στον πνεύμονα (πνευμονική εμβολή), λοίμωξη και επαναπρόσληψη βάρους. Η παγκόσμια βιβλιογραφία αναφέρει κίνδυνο για διαφυγή από τον νεοστόμαχο 0,8-1% και κίνδυνο αιμορραγίας 1%. Ο νεοστόμαχος ελέγχεται στο τέλος της επέμβασης με ειδική μπλε χρωστική για να διασφαλιστεί ότι «δεν υπάρχει διαφυγή». Μέχρι όμως να επουλωθεί πλήρως το στομάχι (4-6 εβδομάδες) θα πρέπει να ακολουθήσετε αυστηρά τις διατροφικές οδηγίες που θα λάβετε με το εξιτήριο. Για την αποφυγή θρόμβων, σας συμβουλεύουμε να συνεχίσετε με τις ελαστικές κάλτσες και μετά το εξιτήριο μέχρι την πλήρη κινητοποίηση. Επίσης θα σας χορηγηθούν ενεσάκια ηπαρίνης χαμηλού μοριακού βάρους για λίγες ημέρες μετά την έξοδο σας από το νοσοκομείο. Η σωματική δραστηριότητα ενθαρρύνεται επίσης από τις πρώτες μετεγχειρητικές ώρες.
Παλινδρόμηση οξέος και/ή χολής (γαστροοισοφαγική παλινδρόμηση ή GORD) μπορεί να αναπτυχθεί στο 5-10% των ασθενών μετά από επιμήκη γαστρεκτομή. Αν και αυτό τείνει να βελτιώνεται με την πάροδο του χρόνου (12-24 μηνών) αν προσαρμοστούν οι διατροφικές συνήθειες (αποφυγή μεγάλων και πλούσιων σε λιπαρά γευμάτων, καλό μάσημα, λήψη της τροφής αργά, αποφυγή γεύματος πριν την κατάκλιση) μπορεί να χρειαστεί θεραπεία με φάρμακα από το στόμα. Σπάνια, μπορεί να χρειαστεί περαιτέρω παρέμβαση. Για τους ασθενείς που έχουν ήδη ήδη γαστροοισοφαγική παλινδρόμηση πριν από τη βαριατρική επέμβαση συνιστάται η γαστρική παράκαμψη παρά η επιμήκης γαστρεκτομή. Ωστόσο, ορισμένοι ασθενείς αναφέρουν ότι η γαστροοισοφαγική παλινδρόμηση βελτιώνεται μετά την επέμβαση καθώς χάνουν βάρος. Εάν εντοπιστεί διαφραγματοκήλη προεγχειρητικά ή κατά τη διάρκεια της επέμβασης, τότε θα προχωρήσουμε στη διόρθωση της ώστε να βοηθήσουμε στη βελτίωση των συμπτωμάτων της γαστροοισοφαγικής παλινδρόμησης.